En termes de gouvernance, le PROMOGED favorise les réformes juridiques du secteur, définissant ainsi les rôles et responsabilités des différentes entités chargées de la gestion des déchets, tant d'un point de vue institutionnel, technique que financier.​

Le renforcement de la gouvernance sectorielle et de la capacité institutionnelle repose sur le dialogue à chaque niveau de gouvernance du PROMOGED.

En effet, la mise en place des quatre organes de coordination du PROMOGED est guidée par :

• Le dialogue politique au sein du comité de pilotage ;
• Le dialogue des parties prenantes avec le comité technique et ses groupes de travail ;
• Le dialogue territorial au sein des comités techniques régionaux et locaux ;
• Le dialogue technique au sein de l’unité de gestion du projet.